被子植物（即開(kāi)花植物）是主要的作物植物，并且在碳匯中具有至關(guān)重要的作用。因此，對(duì)它們的起源進(jìn)行分析，將為我們提供關(guān)于這些作用起源的重要線索。ELISA試劑盒之前的證據(jù)強(qiáng)烈暗示，無(wú)油樟科是所有其他現(xiàn)存開(kāi)花植物的姊妹種系的單一生物物種。在3篇zui近的文章中，無(wú)油樟基因組研究團(tuán)隊(duì)和其他作者發(fā)布了一種新方法，用于測(cè)序非模式物種，例如無(wú)油樟現(xiàn)有的基因組，同時(shí)提供了證據(jù)，表明令人驚訝的大量水平基因轉(zhuǎn)移事件為其線粒體基因組做出了貢獻(xiàn)。
Chamala等人描述了一種針對(duì)具有大型以及復(fù)雜基因組的非模式物種的新的測(cè)序和組裝流水線策略。他們首先利用一種Illumina和Sanger公司的細(xì)菌人工染色體末端組合制造了一種全基因組。他們隨后利用原位雜交中的熒光反應(yīng)評(píng)估了裝配的準(zhǔn)確性，這是之前以這種方式未曾探索過(guò)的一種技術(shù)。zui終，為了進(jìn)一步改進(jìn)裝配的接觸性，他們完成了全基因組繪圖（正式名稱為光學(xué)映射），這使得基因組片段的限制性內(nèi)切酶的順序成為可能，即關(guān)閉了組裝中的剩余空間。
無(wú)油樟基因組研究團(tuán)隊(duì)詮釋了無(wú)油樟科的核序列，并用它來(lái)分析被子植物的進(jìn)化。結(jié)構(gòu)分析證實(shí)了被子植物共同祖先中的一個(gè)全基因組復(fù)制事件，還揭示了導(dǎo)致無(wú)油樟科的世系中并沒(méi)有更進(jìn)一步的此類事件。ELISA試劑盒這種核基因組因此可以作為在其他開(kāi)花植物基因組中闡明進(jìn)化的一個(gè)很好的參考。例如，作者能夠重建真雙子葉植物的祖先——預(yù)六倍體基因排列，構(gòu)成約75％的被子植物。
作者將無(wú)油樟科核基因組與22種陸生植物基因組進(jìn)行了比較，從而鑒別出了超過(guò)1000個(gè)zui初出現(xiàn)在被子植物中的基因，這些基因很可能與被子植物的起源有關(guān)。然而，他們發(fā)現(xiàn)，許多與開(kāi)花有關(guān)的基因早于被子植物的起源時(shí)間，從而意味著這些基因能夠增進(jìn)似花的功能。
Rice等人得到了無(wú)油樟科的3.9Mb的線粒體基因組，這比許多細(xì)菌基因組都大。作為水平基因轉(zhuǎn)移的一個(gè)結(jié)果，它包含了從綠藻、苔蘚和其他被子植物獲得的6個(gè)線粒體基因組的等價(jià)物。水平基因轉(zhuǎn)移的這一規(guī)模包括4種之前未曾發(fā)現(xiàn)的全基因組轉(zhuǎn)移。隨著外來(lái)DNA中獲得如此大的延伸，并*來(lái)自綠色植物的線粒體，作者認(rèn)為轉(zhuǎn)移發(fā)生在于捕獲整個(gè)線粒體，緊隨線粒體融合之后。
無(wú)油樟科的線粒體DNA被認(rèn)為如此不同尋常，這是因?yàn)榕c大部分植物相比，無(wú)油樟科更多暴露在附生植物中，后者是一種在其他植物上生長(zhǎng)的非寄生植物，ELISA試劑盒并且由于它有一個(gè)傾向，能夠維持傷口和生產(chǎn)吸盤(pán)豆芽，這可能導(dǎo)致線粒體轉(zhuǎn)移。zui終，它具有一種異乎尋常低頻率的線粒體DNA損失。
這種新策略毫無(wú)疑問(wèn)對(duì)于其他非模式物種而言也是有用的，并且無(wú)油樟科*的進(jìn)化位置將提供許多開(kāi)花植物進(jìn)化的信息。而水平基因轉(zhuǎn)移也提出了許多關(guān)于線粒體基因轉(zhuǎn)移機(jī)制和線粒體融合進(jìn)化的新問(wèn)題。
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